कुछ जानवरों के विलुप्त होने की समस्या विकासवाद के सिद्धांत में अंतिम स्थान नहीं है और डार्विनियन शिक्षण में सर्वोपरि है। वर्तमान समय में रहने वाली प्रजातियों की संख्या उन जानवरों की कुल संख्या का केवल एक नगण्य हिस्सा है जो कभी ग्रह पर प्रकट हुए हैं (1% से कम)। 99% श्रेणियां अंततः समाप्त हो चुकी हैं, और इसके कई कारण हैं।
विलुप्त होने के लिए अतिसंवेदनशील जानवर भौगोलिक रूप से सीमित क्षेत्रों में एक या एक से अधिक स्थानों में पाए जाते हैं। यदि पूरी श्रृंखला मानव गतिविधि से गुजरी है, तो इसमें रहने वाली प्रजातियां गायब हो सकती हैं। प्राकृतिक परिस्थितियों में कुछ प्रकार के जानवरों के विलुप्त होने का सीधा कारण जनसंख्या आनुवंशिकी के नियमों द्वारा निर्धारित महत्वपूर्ण स्तर से नीचे उनकी संख्या में कमी है। महत्वपूर्ण बहुतायत का स्तर है, जिसके नीचे निकटता से संबंधित क्रॉसिंग की संभावना बड़ी हो जाती है, जिससे प्रजातियों की आनुवंशिक विविधता में कमी आती है। नतीजतन, जन्मजात विकारों के साथ संतानों का अनुपात है जो नई पीढ़ियों में मृत्यु दर में वृद्धि करता है। एक या अधिक आबादी के परिणामस्वरूप बनने वाली प्रजातियां भी तेजी से विलुप्त होने के अधीन हैं। आग, भूकंप, बीमारी और मानवीय गतिविधियों के परिणामस्वरूप कोई भी श्रेणी गायब हो सकती है। विभिन्न आबादी वाली श्रेणियों के विलुप्त होने की संभावना कम होती है। छोटे जानवरों की तुलना में, बड़े जानवरों में विशाल व्यक्तिगत क्षेत्र होते हैं। उन्हें बहुत अधिक भोजन की आवश्यकता होती है, और वे अक्सर मनुष्यों के शिकार बन जाते हैं। बड़े जानवर भगाने के लिए अधिक संवेदनशील होते हैं, न केवल इसलिए कि वे शिकार करते हैं, बल्कि इसलिए भी कि वे खेल के शिकार में मनुष्यों के साथ प्रतिस्पर्धा करते हैं, कभी-कभी लोगों और पशुओं पर हमला करते हैं। जानवरों की आबादी है जो बड़े क्षेत्रों में भोजन करते हैं। उनके विलुप्त होने का भी खतरा है, बशर्ते कि उनकी सीमा का हिस्सा नष्ट हो जाए। प्रकृति के प्राकृतिक विकास के साथ, पर्यावरणीय परिवर्तन कुछ श्रेणियों को नई परिस्थितियों के अनुकूल होने के लिए मजबूर करते हैं। अनुकूलन में असमर्थ जानवरों को उपयुक्त आवासों में प्रवास करने के लिए मजबूर किया जाता है। अन्यथा, उनकी प्रजातियों के विलुप्त होने का खतरा है। प्राकृतिक संसाधनों के विकास की तीव्र गति अनुकूलन को पीछे छोड़ देती है, जिससे पलायन ही एकमात्र विकल्प रह जाता है। जानवरों की श्रेणियां जो खेतों, सड़कों और अन्य अशांत आवासों को पार नहीं कर सकतीं, वे विलुप्त होने के लिए बर्बाद हैं। जानवरों की अत्यधिक मूल्यवान प्रजातियों के विलुप्त होने के लिए उपयोगितावाद हमेशा एक पूर्वापेक्षा रही है। अत्यधिक दोहन से जनसंख्या के आकार में भारी कमी आ सकती है। यदि शिकार को कानून द्वारा नियंत्रित नहीं किया जाता है, तो कुछ प्रकार के जानवर विलुप्त होने के कगार पर हो सकते हैं।